Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3371F7CQW8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3371F7CQW8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms