Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm10477F6SW83 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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