Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc7bE9Q9Y3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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