Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc146E9Q9F7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc146E9Q9F7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms