Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC005561E9Q5E2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BC005561E9Q5E2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms