Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Pdzd2E9Q1M1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Pdzd2E9Q1M1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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