Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Myo5cE9Q1F5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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