Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt78E9Q0F0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Krt78E9Q0F0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms