Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3095E9Q058 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms