Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx60E9PZQ1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Ddx60E9PZQ1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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