Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd1E9PZ26 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms