Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rsph10bE9PYQ0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph10bE9PYQ0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms