Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rsf1E9PWW9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rsf1E9PWW9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms