Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trappc8E9PWG2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms