Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syde2E9PUP1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syde2E9PUP1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms