Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Soga1E1U8D0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms