Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim12cD3Z3L3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms