Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms