Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms