Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf217D3YYI7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf217D3YYI7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms