Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3259D3YUK0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3259D3YUK0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms