Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nlrc5C3VPR6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms