Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cttnbp2B9EJA2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cttnbp2B9EJA2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms