Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apol6B7ZC55 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms