Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cfap58B2RW38 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms