Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apol7aB2RT54 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms