Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rrn3B2RS91 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms