Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms