Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
1700042G07RikB1AUF7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms