Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Tmem238A9JSM3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms