Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skint5A7XUY5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms