Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gbp4A4UUI3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms