Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Odf2A3KGV1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms