Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Samt1A2BED8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Samt1A2BED8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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