Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tubb1A2AQ07 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms