Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scn1aA2APX8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scn1aA2APX8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms