Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frmpd1A2AKB4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frmpd1A2AKB4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms