Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frmpd4A2AFR3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frmpd4A2AFR3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms