Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ttc39aA2ACP1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ttc39aA2ACP1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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