Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Prdm16A2A935 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prdm16A2A935 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Prdm16A2A935 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prdm16A2A935 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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