Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pramef6A2A8M8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms