Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1bA1Z198 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nlrp1bA1Z198 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms