Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc194A0A140LIT1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc194A0A140LIT1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc194A0A140LIT1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc194A0A140LIT1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc194A0A140LIT1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc194A0A140LIT1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc194A0A140LIT1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ccdc194A0A140LIT1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc194A0A140LIT1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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