Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms