Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU3

Trdc, T cell receptor delta, constant region (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdcA0A0G2JEU3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TrdcA0A0G2JEU3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TrdcA0A0G2JEU3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms