Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer3W4VSP1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer3W4VSP1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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