Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Homer1Q9Z2Y3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms