Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CcniQ9Z2V9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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