Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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