Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zkscan5Q9Z1D8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zkscan5Q9Z1D8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zkscan5Q9Z1D8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Zkscan5Q9Z1D8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zkscan5Q9Z1D8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zkscan5Q9Z1D8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Zkscan5Q9Z1D8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zkscan5Q9Z1D8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Zkscan5Q9Z1D8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zkscan5Q9Z1D8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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